Carrie-Anne Moss tardó seis meses en lograr que la patada del escorpión en la escena inicial fuera correcta.
Lilly y Lana Wachowski eligieron a Monica Bellucci como Perséfone después de ver su actuación en la película Malena, del año 2000.
Según las autoridades municipales de Oakland, que trabajaron con los cineastas en las tomas del centro de la ciudad, había que eliminar todos los colores rojo y azul, por lo que se pintaron las aceras y las banquetas. Además, no podía haber vegetación, por lo que el rodaje se hizo en invierno, antes de que brotaran las hojas de los árboles en primavera. Todo porque las cineastas querían que Matrix tuviera un aspecto tan artificial como fuera posible.
El departamento de peluquería y maquillaje gastó 84 frascos de gel para el pelo durante el rodaje.
GM donó 300 autos para usar en la producción de la película. Los 300 fueron destrozados al final.

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